जैसे ही महाभारत युद्ध समाप्त हुआ, पांडव शोक में थे क्योंकि उन्होंने अपने ही रिश्तेदारों को मारकर पाप किया था और दैवीय नाराजगी अर्जित की थी। उन्होंने इसका समाधान खोजने के लिए भगवान कृष्ण से मिलने का फैसला किया, जिन्होंने बदले में पांडवों को एक काला झंडा और एक काली गाय सौंपी और उनका पालन करने के लिए कहा। उन्होंने पांडवों से कहा कि जब गाय और झंडा सफेद हो जाएगा, तो उन्हें माफ कर दिया जाएगा। इसके अलावा, कृष्ण ने उन्हें भगवान शिव की तपस्या करने की भी सलाह दी। पांडव तब गाय का पीछा करते थे जहाँ भी वह झंडा लेकर जाती थी और जब वे गुजरात के भावनगर में कोलियाक समुद्र तट पर पहुँचे, तो गाय और ध्वज दोनों का रंग बदल गया। उन्होंने वहां भगवान शिव से प्रार्थना की और पांडवों की भक्ति से प्रभावित होकर शिव प्रत्येक भाई के लिए लिंगम रूप में प्रकट हुए। भाइयों के सामने पांच स्वयंभू लिंग दिखाई दिए और इसे ही निष्कलंक महादेव के नाम से जाना जाता है।
निष्कलंक का अर्थ है स्वच्छ, शुद्ध और दोषरहित। ऐसा माना जाता है कि पांडवों ने भाद्र महीने में अमावस्या या अमावस्या की रात को इस मंदिर की स्थापना की थी और प्रतिवर्ष इस मंदिर में भद्रवी नामक एक प्रसिद्ध मेला आयोजित किया जाता है। यह मंदिर एक द्वीप पर स्थित है, जो कोलियाक से लगभग 3 किमी पूर्व में है। प्रत्येक लिंग के सामने एक नंदी बैल है। यहां एक तालाब भी है जहां भक्त भगवान शिव की पूजा करने से पहले हाथ-पैर धोते हैं। इस मंदिर के बारे में सबसे दिलचस्प बात यह है कि यहां ज्वार बहुत सक्रिय हैं क्योंकि यह मंदिर समुद्र के बीच में स्थित है और भक्त मंदिर में प्रवेश करने के लिए समुद्र के पानी के घटने का इंतजार करते हैं। समुद्र का पानी कुछ घंटों के लिए ही घटता है और यही वह समय है जब भक्त निष्कलंक महादेव के पास पहुंचते हैं। कहा जाता है कि शाम 7 बजे के बाद मंदिर फिर से ज्वार की चपेट में आ जाता है।
लोगों का मानना है कि अपने प्रियजनों की अस्थियों को इन जल में विसर्जित करने से उन दिवंगत आत्माओं को मोक्ष प्राप्त करने में मदद मिलती है। इस मंदिर के बारे में एक और दिलचस्प बात यह है कि मंदिर उत्सव की शुरुआत में जो झंडा फहराया जाता है वह 364 दिनों तक रहता है और केवल अगले मंदिर उत्सव के दौरान ही बदला जाता है; ऐसा कहा जाता है कि झंडा कभी नीचे नहीं गिरा या ज्वार से धुल गया। खैर, यह मंदिर निश्चित रूप से एक चमत्कार है।